DNA—STR检测技术的发展历史、常规实验室设备以及STR快检技术简述

2025-03-28

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短串联重复序列(Short Tandem Repeats, STR)是基因组中由1-6个碱基对为核心重复单元组成的多态性区域。自20世纪90年代以来,STR检测技术凭借其高灵敏度、高鉴别能力和标准化操作流程,迅速成为法医学、亲子鉴定、疾病诊断等领域的核心技术。随着技术进步,STR快检技术逐步实现从实验室到现场应用的跨越。

一、STR技术的发展历史
STR技术的演进与人类对遗传标记的探索密不可分,其发展历程可分为三个阶段:

1. 早期探索与VNTR时代(1980年代前)
在STR技术兴起前,可变数目串联重复序列(VNTR)是主流的遗传标记。但VNTR片段较长(通常超过1kb),扩增效率低且易受降解样本限制,逐渐被更短的STR取代。

2. STR技术的崛起(1990年代-2000年代)
STR因其片段短(100-300bp)、扩增效率高、多态性丰富等优势,被法医学界广泛采用。1997年,美国FBI推出包含13个核心STR位点的CODIS系统,标志着STR标准化应用的开始。同时,STR在亲子鉴定中取代传统血型分析,成为司法认定的金标准。例如,通过复合扩增多个STR位点,累计匹配概率可达十亿分之一,显著提升个体识别精度。

3. 高通量与快检技术的融合(2010年至今)
随着AI自动化图谱分析软件和微流控技术的突破,STR检测从依赖毛细管电泳的“分型时代”逐渐迈入高效率、自动化的“快检时代”。由美国引入我国的安地DNA快速检测设备,可在90分钟内完成5个样本的“处理、分析、STR图谱输出”的全流程,且支持在案发现场使用。

二、STR检测的实验室设备体系  
STR检测涉及DNA提取、扩增、分离与分析三大步骤,在实验室需要依赖一系列精密仪器与自动化设备:

1. 样本前处理设备
自动化核酸提取工作站:如磁珠法提取系统,可自动完成裂解、吸附、洗涤和洗脱步骤,避免人工操作污染,单次处理量可达2万样本/年。
半自动打孔系统:用于快速转移干燥血样(如FTA卡)至微孔板,集成条码识别功能,确保样本信息与下游分析无缝对接。

2.扩增与检测设备
PCR仪:采用热启动DNA聚合酶,支持多重STR位点复合扩增,扩增效率高达95%以上。  
毛细管电泳仪:通过荧光标记检测STR片段长度,分辨率达1bp,结合分子量内标实现精准分型。

3.辅助设备与质控系统
超纯水系统:提供电阻率18.2 MΩ·cm的超纯水,确保试剂配制无污染。
生物安全柜与超净工作台:维持百级洁净环境,防止气溶胶污染。
数据库服务器:存储海量STR图谱(如CODIS系统),支持快速比对与数据共享。

三、STR检测向快速高效方向发展
为满足案发现场检测与司法时效性需求,STR检测技术通过设备集成、流程优化和智能化分析等途径力求实现质的飞跃和效率的突破:

1.  一体化快速检测设备   
新崛起的DNA快检设备,如“安地DNA快速检测系统”,整合了DNA样本裂解、扩增与电泳模块于一体化便携式芯片,装入快检仪器后可在现场90分钟内输出STR图谱。其特点包括:
微流控芯片技术:将DNA提取、扩增、分离所需所有试剂预封装于芯片,减少人工干预。
- 多通道检测:支持5通道同步运行,兼容血液、唾液、毛发、骨骼等多样本类型。

2.  免提取扩增技术
实验室通过改良裂解缓冲液,直接对血斑、唾液斑等样本进行扩增,省去传统DNA纯化步骤。利用专门的“血卡直扩”方案,可将实验室检测周期缩短至4小时。

3. 人工智能辅助分型
以往在实验室,专家利用Genemapper ID-X等软件,识别电泳峰图并排除杂质干扰。而在如安地DNA快检系统的快检仪中,植入了内置专家判读模块,可以直接分析得出电泳图谱,输出数据格式支持与实验室数据库比对,提升了大量DNA样本的分析比对效率。

4. 现场DNA快检方案应用
针对野外或灾害现场,目前已有了车载DNA实验室、现场DNA快检仪等解决方案。例如安地DNA快检仪设备,可专门用于现场STR实验,设备重量50kg左右,可以车载或2人搬运,配套最小型号锂电池可续航6小时,可分4次处理20个DNA样本,适用于犯罪现场快速筛查。

四、未来展望
STR快检技术的核心挑战在于平衡速度与精度。未来发展趋势包括:
纳米孔测序技术:通过单分子实时测序,实现STR分型与序列变异的同步检测。
全自动机器人平台:整合样本处理、扩增与分析模块,实现“样本进-结果出”的无人化操作。
多组学数据融合:结合SNP和甲基化标记,拓展STR在癌症早筛与种群遗传学中的应用。

从实验室到现场检测,STR快检技术的发展史是一部技术创新与需求驱动的交响曲。随着设备微型化、流程智能化和数据分析深度化,STR技术将在司法公正、医疗诊断及公共安全领域持续释放潜力,为人类社会的精准治理提供科学基石。


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